Il Centro è formalmente rappresentato da due specifici organi: il Direttore e il Consiglio del Centro. Il Direttore è il Prof. Ruggero Bettini, che ha facoltà di rappresentare BIOPHARMANET-TEC in ogni ambito e si relaziona con soggetti interni ed esterni. Ha inoltre responsabilità amministrative e di controllo, di coordinamento scientifico e di mantenimento dei requisiti di accreditamento. Il Consiglio del Centro ha funzioni consultive e propositive, di indirizzo strategico e approvazione della programmazione finanziaria, ed è costituito dal Direttore del Centro, dai Direttori dei dipartimenti afferenti (o loro delegati) e dai Ricercatori aderenti. Altre figure del centro sono: Vice Direttore: Prof.ssa Alessia Bacchi. Coordinatore amministrativo: Dr.ssa Marina Cassano (svolge adempimenti amministrativi e contabili e supporta il Direttore nelle sue funzioni gestionali). Responsabile Audit Interno: Prof.ssa Barbara Campanini. Responsabile Marketing & Relazioni Esterne: Dr.ssa Marina Cassano (ha in carico la gestione della comunicazione, delle relazioni con il sistema imprenditoriale e dei contatti con gli altri membri della Rete Alta Tecnologia). Responsabile Sistema Qualità: Prof. Fabio Sonvico (controlla la corretta applicazione delle procedure definite per la gestione del Centro, gestisce il Manuale di Accreditamento e analizza i dati sulla soddisfazione dei clienti, proponendo azioni correttive e di miglioramento per le attività del Centro). Responsabile del procedimento di pubblicazione dei contenuti sul sito web (RPP): Prof Marco Pieroni. I ricercatori afferenti al centro sono suddivisi in 5 Unità Operative, ciascuna recante una specifica expertise nei vari campi del settore farmaceutico, veterinario, cosmetico e nutraceutico.